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#OpenScience-2

Une organisation des données pour l’utilisation, le partage et le réutilisation

  • Doter l’Inra de portails des données, outils nécessaires pour gérer l’accès aux données de la recherche tout en sécurisant ce patrimoine ainsi que l’importation de données produites par d’autres ; définir les règles de standardisation des données, de partage des ontologies, de couplage et d’interopérabilité des modèles
  • Développer le partenariat, notamment avec le CEA, le CNRS, Inria et Irstea mais aussi les acteurs du développement et de l’innovation ; contribuer en partenariat à la création d’un institut interdisciplinaire sur l’agriculture numérique.
Mots-clés : OPENSCIENCE-2

La forêt a de la ressource !

 
 
Publié le 20/01/2018

Création d’un pilier « Forêt » dans l’infrastructure RARe (Ressources Agronomiques pour la Recherche)

Conscient de l’importance de ses ressources biologiques, cœur du processus de recherche, le département EFPA a décidé de structurer leur gestion en format centre de ressources biologiques et de rejoindre l’infrastructure de recherche RARe (Ressources Agronomiques pour la Recherche). Dans ce cadre, trois unités expérimentales (UEFMUE GBFOrUE FP) et trois unités (mixte) d...

Impact de la domestication des espèces végétales sur l‘expression des génomes

 
 
Publié le 18/01/2018

les phénomènes sélectifs, tels que la domestication, ont de profondes conséquences à l’échelle du génome

Dans le cadre du projet ARCAD, deux études novatrices ont permis de mettre en évidence le rôle prépondérant du phénomène de conversion génique (gBGC) par rapport à la sélection sur les variations de composition en bases G et C chez 11 espèces d’angiospermes et le profond dérèglement transcriptionnel induit par la domestication chez une espèce d’intérêt agronomi...

Analyse de la composition globale du lait maternel humain précoce

 
 
Publié le 17/01/2018

mise en relation avec les facteurs maternels et environnementaux et impact sur le développement d’une allergie alimentaire dans l’enfance

En collaboration avec l’Inserm, et dans le cadre d'une thèse (Mikaïl Berdi) co-financée par l’INRA et le CEA, nous avons établi les cartographies individuelles de la composition globale (métabolites, facteurs immunologiques et de croissance) de plus de 300 échantillons de laits maternels précoces collectés au sein de la cohorte mère-enfant...

OpenMinTeD, une plateforme européenne pour des services de fouille de textes

 
 
Publié le 07/01/2018

Une e-infrastructure européenne de texte-mining

L'équipe Bibliome en collaboration avec la DIST a contribué au développement de l'e-infrastructure europénne OpenMinTeD. OpenMinTeD facilite l'appropriation des technologies de text mining pour la recherche scientifique. Elle s'appuie sur des outils et plates-formes de text mining existants et les rend identifiables automatiquement grâce à des catalogues, et interopérables grâce à des standards. Des services développés en sciences de...

Des méthodes d'intelligence artificielle pour la conception et la simulation de modèles épidémiologiques multi-échelles en santé animale

 
 
Publié le 06/01/2018

la nécessité d'intégrer des expertises multiples

Pour accélérer et fiabiliser le développement de simulations en épidémiologie, nous avons utilisé des méthodes d'intelligence artificielle pour expliciter la structure des modèles et réduire la part de code à écrire. Appliquée d'abord à des modèles intra- et inter-troupeaux pour une zoonose animale, cette approche logicielle générique permet de couvrir des besoins récurrents en modélisation des maladies transmissibles dans l...